Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTAN1Q13813 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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