Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 UBE2G1-201ENST00000396981 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.485e-6■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 UBE2G1-202ENST00000571953 553 ntTSL 37.39□□□□□ -1.237e-6■■■□□ 19.2
ILF3Q12906 PTP4A1-202ENST00000470661 479 ntTSL 26.54□□□□□ -1.361e-6■■■□□ 19.1
ILF3Q12906 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.278e-7■■■□□ 19.1
ILF3Q12906 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.598e-7■■■□□ 19.1
ILF3Q12906 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.611e-7■■■□□ 19.1
ILF3Q12906 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.441e-7■■■□□ 19.1
ILF3Q12906 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.311e-7■■■□□ 19.1
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ILF3Q12906 WIPF3-201ENST00000242140 4184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.57e-8■■■□□ 19.1
ILF3Q12906 WIPF3-203ENST00000409290 4002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.057e-8■■■□□ 19.1
ILF3Q12906 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.635e-7■■■□□ 19.1
ILF3Q12906 CHCHD6-207ENST00000514908 713 ntTSL 318.95■□□□□ 0.625e-7■■■□□ 19.1
ILF3Q12906 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.65e-7■■■□□ 19.1
ILF3Q12906 CHCHD6-202ENST00000503119 1148 ntTSL 1 (best)18.7■□□□□ 0.585e-7■■■□□ 19.1
ILF3Q12906 CHCHD6-206ENST00000513253 690 ntTSL 311.13□□□□□ -0.635e-7■■■□□ 19.1
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ILF3Q12906 PSPC1-203ENST00000471658 1647 ntTSL 1 (best)18.78■□□□□ 0.62e-6■■■□□ 19.1
ILF3Q12906 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.45e-7■■■□□ 19.1
ILF3Q12906 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.235e-7■■■□□ 19.1
ILF3Q12906 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.095e-7■■■□□ 19.1
ILF3Q12906 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.465e-7■■■□□ 19.1
ILF3Q12906 LRCH3-205ENST00000433298 977 ntTSL 57.37□□□□□ -1.235e-7■■■□□ 19.1
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ILF3Q12906 LRCH3-209ENST00000452660 681 ntTSL 52.53□□□□□ -25e-7■■■□□ 19.1
ILF3Q12906 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.134e-7■■■□□ 19.1
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ILF3Q12906 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.722e-6■■■□□ 19.1
ILF3Q12906 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.732e-6■■■□□ 19.1
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ILF3Q12906 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.071e-9■■■□□ 19
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ILF3Q12906 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.581e-6■■■□□ 19
ILF3Q12906 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.121e-6■■■□□ 19
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ILF3Q12906 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.784e-10■■■□□ 19
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ILF3Q12906 KDM4C-202ENST00000381309 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.011e-6■■■□□ 19
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ILF3Q12906 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.551e-6■■■□□ 19
ILF3Q12906 DHRSX-203ENST00000430536 490 ntTSL 221.18■□□□□ 0.987e-9■■■□□ 19
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ILF3Q12906 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.121e-23■■■□□ 19
ILF3Q12906 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.171e-23■■■□□ 19
ILF3Q12906 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.31e-23■■■□□ 19
ILF3Q12906 AGPAT1-204ENST00000395496 2103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.491e-23■■■□□ 19
ILF3Q12906 AGPAT1-206ENST00000395499 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.591e-23■■■□□ 19
ILF3Q12906 AGPAT1-208ENST00000490711 2448 ntTSL 29.36□□□□□ -0.911e-23■■■□□ 19
ILF3Q12906 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.128e-15■■■□□ 19
ILF3Q12906 USB1-212ENST00000566082 3888 ntTSL 29.81□□□□□ -0.848e-15■■■□□ 19
ILF3Q12906 AFMID-205ENST00000586731 550 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.499e-8■■■□□ 19
ILF3Q12906 AFMID-210ENST00000589256 578 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.499e-8■■■□□ 19
ILF3Q12906 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.456e-7■■■□□ 19
ILF3Q12906 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.256e-7■■■□□ 19
ILF3Q12906 RAB7A-207ENST00000491681 552 ntTSL 24.78□□□□□ -1.646e-7■■■□□ 19
ILF3Q12906 STRN3-207ENST00000555358 2208 ntTSL 1 (best)22.13■■□□□ 1.137e-7■■■□□ 19
ILF3Q12906 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.317e-7■■■□□ 19
ILF3Q12906 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.117e-7■■■□□ 19
ILF3Q12906 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.317e-17■■■□□ 19
ILF3Q12906 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.177e-17■■■□□ 19
ILF3Q12906 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.077e-17■■■□□ 19
ILF3Q12906 ZNF789-208ENST00000481472 411 ntTSL 415.13■□□□□ 0.017e-17■■■□□ 19
ILF3Q12906 ZNF789-203ENST00000447047 842 ntTSL 515.13■□□□□ 0.017e-17■■■□□ 19
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