Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFFO1Q0D2I5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFFO1Q0D2I5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms