Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPIBQ01892 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms