Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF2Q01130 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF2Q01130 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms