Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP2C1P98194 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2C1P98194 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms