Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPEP62304 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPEP62304 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms