Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA8P53708 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms