Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN1S1P47710 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms