Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX2-1P43699 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms