Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECI1P42126 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECI1P42126 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECI1P42126 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECI1P42126 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECI1P42126 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECI1P42126 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECI1P42126 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECI1P42126 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ECI1P42126 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ECI1P42126 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECI1P42126 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ECI1P42126 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ECI1P42126 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECI1P42126 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ECI1P42126 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ECI1P42126 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ECI1P42126 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ECI1P42126 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ECI1P42126 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ECI1P42126 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECI1P42126 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECI1P42126 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ECI1P42126 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECI1P42126 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECI1P42126 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECI1P42126 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECI1P42126 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECI1P42126 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECI1P42126 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECI1P42126 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECI1P42126 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECI1P42126 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECI1P42126 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECI1P42126 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECI1P42126 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECI1P42126 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECI1P42126 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECI1P42126 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECI1P42126 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECI1P42126 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ECI1P42126 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ECI1P42126 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECI1P42126 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECI1P42126 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ECI1P42126 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECI1P42126 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECI1P42126 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECI1P42126 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECI1P42126 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECI1P42126 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECI1P42126 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECI1P42126 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ECI1P42126 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ECI1P42126 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ECI1P42126 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECI1P42126 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECI1P42126 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECI1P42126 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECI1P42126 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECI1P42126 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECI1P42126 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECI1P42126 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECI1P42126 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECI1P42126 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECI1P42126 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECI1P42126 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECI1P42126 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms