Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP5C1P36542 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP5C1P36542 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP5C1P36542 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATP5C1P36542 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATP5C1P36542 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATP5C1P36542 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms