Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
S100A1P23297 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
S100A1P23297 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
S100A1P23297 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
S100A1P23297 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
S100A1P23297 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
S100A1P23297 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
S100A1P23297 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
S100A1P23297 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
S100A1P23297 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
S100A1P23297 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
S100A1P23297 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
S100A1P23297 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
S100A1P23297 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
S100A1P23297 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
S100A1P23297 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
S100A1P23297 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
S100A1P23297 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
S100A1P23297 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
S100A1P23297 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
S100A1P23297 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
S100A1P23297 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
S100A1P23297 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
S100A1P23297 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
S100A1P23297 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
S100A1P23297 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
S100A1P23297 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
S100A1P23297 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
S100A1P23297 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
S100A1P23297 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
S100A1P23297 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
S100A1P23297 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
S100A1P23297 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
S100A1P23297 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
S100A1P23297 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
S100A1P23297 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
S100A1P23297 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
S100A1P23297 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
S100A1P23297 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
S100A1P23297 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
S100A1P23297 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
S100A1P23297 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
S100A1P23297 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
S100A1P23297 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
S100A1P23297 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
S100A1P23297 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
S100A1P23297 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
S100A1P23297 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
S100A1P23297 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
S100A1P23297 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
S100A1P23297 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
S100A1P23297 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
S100A1P23297 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
S100A1P23297 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
S100A1P23297 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
S100A1P23297 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
S100A1P23297 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
S100A1P23297 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
S100A1P23297 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
S100A1P23297 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
S100A1P23297 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
S100A1P23297 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
S100A1P23297 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
S100A1P23297 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
S100A1P23297 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
S100A1P23297 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
S100A1P23297 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
S100A1P23297 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
S100A1P23297 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
S100A1P23297 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
S100A1P23297 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
S100A1P23297 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
S100A1P23297 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
S100A1P23297 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
S100A1P23297 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
S100A1P23297 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
S100A1P23297 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
S100A1P23297 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
S100A1P23297 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
S100A1P23297 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
S100A1P23297 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
S100A1P23297 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
S100A1P23297 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
S100A1P23297 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
S100A1P23297 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
S100A1P23297 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
S100A1P23297 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
S100A1P23297 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
S100A1P23297 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
S100A1P23297 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
S100A1P23297 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
S100A1P23297 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
S100A1P23297 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
S100A1P23297 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
S100A1P23297 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
S100A1P23297 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
S100A1P23297 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
S100A1P23297 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
S100A1P23297 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
S100A1P23297 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms