Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALB2P22676 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALB2P22676 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALB2P22676 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALB2P22676 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALB2P22676 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALB2P22676 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALB2P22676 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CALB2P22676 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALB2P22676 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALB2P22676 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALB2P22676 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALB2P22676 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALB2P22676 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALB2P22676 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALB2P22676 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALB2P22676 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALB2P22676 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CALB2P22676 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CALB2P22676 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALB2P22676 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALB2P22676 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALB2P22676 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALB2P22676 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALB2P22676 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALB2P22676 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALB2P22676 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALB2P22676 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALB2P22676 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALB2P22676 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALB2P22676 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALB2P22676 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALB2P22676 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALB2P22676 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALB2P22676 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALB2P22676 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALB2P22676 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALB2P22676 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALB2P22676 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALB2P22676 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CALB2P22676 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALB2P22676 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALB2P22676 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALB2P22676 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALB2P22676 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALB2P22676 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALB2P22676 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALB2P22676 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALB2P22676 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CALB2P22676 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CALB2P22676 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALB2P22676 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALB2P22676 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALB2P22676 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALB2P22676 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALB2P22676 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CALB2P22676 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALB2P22676 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CALB2P22676 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALB2P22676 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALB2P22676 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALB2P22676 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALB2P22676 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALB2P22676 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALB2P22676 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALB2P22676 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALB2P22676 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALB2P22676 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALB2P22676 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALB2P22676 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALB2P22676 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALB2P22676 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALB2P22676 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CALB2P22676 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALB2P22676 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALB2P22676 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALB2P22676 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALB2P22676 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALB2P22676 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALB2P22676 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALB2P22676 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALB2P22676 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALB2P22676 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALB2P22676 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALB2P22676 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALB2P22676 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALB2P22676 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALB2P22676 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALB2P22676 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALB2P22676 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALB2P22676 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALB2P22676 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALB2P22676 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALB2P22676 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALB2P22676 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALB2P22676 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALB2P22676 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALB2P22676 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALB2P22676 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALB2P22676 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms