Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB1P16220 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB1P16220 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB1P16220 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB1P16220 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB1P16220 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB1P16220 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB1P16220 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB1P16220 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB1P16220 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB1P16220 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB1P16220 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB1P16220 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB1P16220 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB1P16220 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB1P16220 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB1P16220 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB1P16220 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB1P16220 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB1P16220 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB1P16220 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB1P16220 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB1P16220 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB1P16220 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB1P16220 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB1P16220 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB1P16220 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB1P16220 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB1P16220 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB1P16220 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB1P16220 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB1P16220 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB1P16220 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB1P16220 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB1P16220 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB1P16220 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB1P16220 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB1P16220 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB1P16220 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB1P16220 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB1P16220 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB1P16220 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB1P16220 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB1P16220 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB1P16220 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB1P16220 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB1P16220 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CREB1P16220 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CREB1P16220 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB1P16220 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB1P16220 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB1P16220 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB1P16220 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB1P16220 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB1P16220 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB1P16220 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB1P16220 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB1P16220 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB1P16220 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB1P16220 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB1P16220 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB1P16220 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB1P16220 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB1P16220 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB1P16220 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB1P16220 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB1P16220 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB1P16220 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB1P16220 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB1P16220 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB1P16220 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB1P16220 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB1P16220 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB1P16220 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB1P16220 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB1P16220 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB1P16220 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB1P16220 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB1P16220 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB1P16220 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB1P16220 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB1P16220 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB1P16220 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB1P16220 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB1P16220 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB1P16220 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB1P16220 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB1P16220 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB1P16220 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB1P16220 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB1P16220 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB1P16220 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB1P16220 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB1P16220 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB1P16220 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB1P16220 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB1P16220 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB1P16220 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CREB1P16220 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CREB1P16220 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms