Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR2F1P10589 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NR2F1P10589 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms