Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB11O95342 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms