Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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PDE6DO43924 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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PDE6DO43924 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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PDE6DO43924 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDE6DO43924 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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PDE6DO43924 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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PDE6DO43924 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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