Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
EFNA2O43921 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EFNA2O43921 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms