Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF13O43567 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF13O43567 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF13O43567 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF13O43567 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF13O43567 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF13O43567 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF13O43567 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF13O43567 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF13O43567 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF13O43567 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF13O43567 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF13O43567 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF13O43567 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF13O43567 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF13O43567 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF13O43567 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF13O43567 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF13O43567 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF13O43567 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF13O43567 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF13O43567 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF13O43567 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF13O43567 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF13O43567 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF13O43567 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF13O43567 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF13O43567 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF13O43567 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF13O43567 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF13O43567 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF13O43567 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF13O43567 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF13O43567 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF13O43567 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF13O43567 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF13O43567 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF13O43567 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF13O43567 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF13O43567 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF13O43567 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF13O43567 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF13O43567 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF13O43567 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF13O43567 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF13O43567 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF13O43567 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF13O43567 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF13O43567 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF13O43567 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF13O43567 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF13O43567 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF13O43567 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF13O43567 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF13O43567 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF13O43567 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF13O43567 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF13O43567 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF13O43567 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF13O43567 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF13O43567 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF13O43567 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF13O43567 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF13O43567 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF13O43567 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF13O43567 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF13O43567 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF13O43567 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF13O43567 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF13O43567 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF13O43567 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF13O43567 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF13O43567 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF13O43567 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF13O43567 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF13O43567 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF13O43567 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF13O43567 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF13O43567 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF13O43567 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF13O43567 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF13O43567 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF13O43567 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF13O43567 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF13O43567 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF13O43567 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF13O43567 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF13O43567 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF13O43567 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF13O43567 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF13O43567 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF13O43567 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF13O43567 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF13O43567 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF13O43567 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF13O43567 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF13O43567 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF13O43567 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF13O43567 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF13O43567 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms