Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MEFVO15553 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MEFVO15553 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MEFVO15553 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MEFVO15553 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MEFVO15553 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MEFVO15553 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MEFVO15553 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MEFVO15553 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MEFVO15553 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MEFVO15553 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MEFVO15553 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MEFVO15553 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MEFVO15553 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MEFVO15553 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MEFVO15553 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MEFVO15553 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MEFVO15553 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MEFVO15553 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MEFVO15553 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MEFVO15553 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MEFVO15553 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MEFVO15553 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MEFVO15553 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MEFVO15553 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MEFVO15553 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MEFVO15553 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MEFVO15553 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MEFVO15553 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MEFVO15553 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MEFVO15553 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MEFVO15553 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MEFVO15553 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MEFVO15553 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MEFVO15553 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MEFVO15553 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MEFVO15553 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MEFVO15553 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MEFVO15553 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MEFVO15553 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MEFVO15553 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MEFVO15553 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MEFVO15553 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MEFVO15553 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MEFVO15553 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MEFVO15553 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MEFVO15553 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MEFVO15553 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MEFVO15553 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MEFVO15553 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MEFVO15553 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MEFVO15553 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MEFVO15553 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MEFVO15553 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MEFVO15553 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MEFVO15553 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MEFVO15553 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MEFVO15553 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MEFVO15553 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MEFVO15553 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MEFVO15553 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MEFVO15553 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MEFVO15553 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MEFVO15553 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MEFVO15553 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MEFVO15553 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MEFVO15553 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MEFVO15553 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MEFVO15553 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MEFVO15553 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms