Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1BO15143 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms