Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3KR12 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3KR12 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3KR12 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3KR12 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3KR12 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3KR12 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3KR12 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3KR12 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3KR12 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3KR12 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3KR12 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3KR12 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3KR12 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3KR12 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KR12 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KR12 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KR12 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KR12 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KR12 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KR12 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KR12 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KR12 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KR12 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KR12 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KR12 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KR12 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KR12 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KR12 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KR12 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KR12 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KR12 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KR12 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KR12 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KR12 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KR12 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KR12 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KR12 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KR12 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KR12 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KR12 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KR12 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KR12 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3KR12 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KR12 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KR12 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KR12 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KR12 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KR12 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KR12 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KR12 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KR12 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KR12 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KR12 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KR12 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KR12 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KR12 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KR12 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KR12 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KR12 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KR12 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KR12 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KR12 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KR12 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
J3KR12 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
J3KR12 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
J3KR12 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
J3KR12 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
J3KR12 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
J3KR12 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
J3KR12 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
J3KR12 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KR12 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KR12 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KR12 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KR12 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KR12 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KR12 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KR12 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KR12 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KR12 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KR12 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KR12 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KR12 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KR12 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KR12 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KR12 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KR12 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KR12 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3KR12 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KR12 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KR12 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KR12 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KR12 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KR12 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KR12 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KR12 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KR12 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KR12 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KR12 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms