Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DEV8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DEV8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DEV8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DEV8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DEV8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DEV8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DEV8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DEV8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DEV8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DEV8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DEV8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DEV8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DEV8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DEV8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DEV8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DEV8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DEV8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DEV8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DEV8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DEV8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DEV8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DEV8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DEV8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DEV8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DEV8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
B4DEV8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DEV8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DEV8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DEV8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DEV8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DEV8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DEV8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DEV8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DEV8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DEV8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DEV8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DEV8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DEV8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
B4DEV8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DEV8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DEV8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DEV8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DEV8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DEV8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DEV8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DEV8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DEV8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DEV8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
B4DEV8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DEV8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DEV8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DEV8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DEV8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DEV8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DEV8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DEV8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DEV8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DEV8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DEV8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DEV8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DEV8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DEV8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DEV8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DEV8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DEV8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DEV8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DEV8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DEV8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DEV8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DEV8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DEV8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DEV8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DEV8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DEV8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DEV8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DEV8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DEV8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4DEV8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms