Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
A4D1N5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
A4D1N5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
A4D1N5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
A4D1N5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
A4D1N5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4D1N5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4D1N5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4D1N5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4D1N5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4D1N5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4D1N5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4D1N5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4D1N5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4D1N5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4D1N5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4D1N5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4D1N5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4D1N5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4D1N5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4D1N5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4D1N5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
A4D1N5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4D1N5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4D1N5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4D1N5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4D1N5 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4D1N5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4D1N5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4D1N5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
A4D1N5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
A4D1N5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A4D1N5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A4D1N5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4D1N5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4D1N5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4D1N5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4D1N5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4D1N5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4D1N5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4D1N5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4D1N5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4D1N5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4D1N5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4D1N5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4D1N5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4D1N5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4D1N5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4D1N5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4D1N5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4D1N5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4D1N5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4D1N5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4D1N5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4D1N5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4D1N5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4D1N5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
A4D1N5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4D1N5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4D1N5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4D1N5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4D1N5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4D1N5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms