Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G8

TRBV10-2, T-cell receptor beta variable 10-2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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