Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 AC096743.1-201ENST00000485172 319 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 AC073488.2-201ENST00000631903 751 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 SP140-205ENST00000420434 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 MEIS1-202ENST00000398506 3530 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 MRPS18C-201ENST00000295491 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 AC004672.1-201ENST00000513082 2088 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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HTR4Q13639 NLRC4-204ENST00000404025 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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HTR4Q13639 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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HTR4Q13639 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 SLC9A9-201ENST00000316549 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 RBM11-201ENST00000400577 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 ZMYM6-203ENST00000373333 1473 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 ZNF350-201ENST00000243644 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HTR4Q13639 ACTA2-AS1-201ENST00000437930 2450 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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