Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA3Q9Y6H8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA3Q9Y6H8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA3Q9Y6H8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA3Q9Y6H8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA3Q9Y6H8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA3Q9Y6H8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA3Q9Y6H8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA3Q9Y6H8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA3Q9Y6H8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA3Q9Y6H8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA3Q9Y6H8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA3Q9Y6H8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA3Q9Y6H8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA3Q9Y6H8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA3Q9Y6H8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA3Q9Y6H8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA3Q9Y6H8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA3Q9Y6H8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms