Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC2Q9Y235 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms