Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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USP18Q9UMW8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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USP18Q9UMW8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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USP18Q9UMW8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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USP18Q9UMW8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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USP18Q9UMW8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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USP18Q9UMW8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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USP18Q9UMW8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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USP18Q9UMW8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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USP18Q9UMW8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
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