Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMCC3Q9ULS5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.4 ms