Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CC2D2AQ9P2K1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CC2D2AQ9P2K1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms