Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
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