Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE2

TSHZ2, Teashirt homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ2Q9NRE2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSHZ2Q9NRE2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSHZ2Q9NRE2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms