Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C8orf4Q9NR00 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms