Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LY9Q9HBG7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms