Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTDSP1Q9GZU7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTDSP1Q9GZU7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms