Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM55Q9BYV6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms