Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms