Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RSG1Q9BU20 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RSG1Q9BU20 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms