Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF13CQ96RJ3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms