Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH12Q96NR8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RDH12Q96NR8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms