Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM17Q96I25 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM17Q96I25 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM17Q96I25 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM17Q96I25 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM17Q96I25 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM17Q96I25 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM17Q96I25 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM17Q96I25 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM17Q96I25 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms