Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MALSU1Q96EH3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms