Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGBD4Q96DM1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms