Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA1Q92743 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms