Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW36

ZCCHC13, Zinc finger CCHC domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC13Q8WW36 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ZCCHC13Q8WW36 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms