Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NHLRC2Q8NBF2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NHLRC2Q8NBF2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms