Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL2Q8N4E4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms