Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A10Q6U841 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A10Q6U841 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms